Die Hauptziele des SECO sind der Einbezug der Partnerländer in die Weltwirtschaft und die Förderung ihres nachhaltigen Wirtschaftswachstums. Damit trägt das SECO zur Verminderung der Armut bei. Die Prioritäten liegen auf der Förderung stabiler wirtschaftlicher Rahmenbedingungen, der Stärkung der Wettbewerbsfähigkeit und der Sicherstellung eines diversifizierten Handels, der Mobilisierung von in- und ausländischen Investitionen sowie der Verbesserung der Basisinfrastruktur. Fragen im Zusammenhang mit der wirtschaftlichen Gouvernanz, dem Klima, der Energie und der Umwelt wird eine besondere Aufmerksamkeit geschenkt.